Ο ισχυρός μεσογειακός κυκλώνας «Ιανός», που προκάλεσε τη φονική πλημμύρα της 19ης Σεπτεμβρίου, η οποία έπληξε ολόκληρη την πόλη της Καρδίτσας, προκάλεσε σημαντικές ζημιές και στο Αρχαιολογικό Μουσείο της πόλης, καθώς ο υπόγειος χώρος του μουσείου γέμισε με νερά και λάσπη σε ύψος τουλάχιστον 2 μέτρων. Αποτέλεσμα ήταν τα κιβώτια με τα αρχαία αντικείμενα να παρασυρθούν από το νερό και να διασκορπιστεί το περιεχόμενό τους.
Το Αρχαιολογικό Μουσείο Καρδίτσας διαθέτει υπόγειο χώρο αποθηκών και ηλεκτρομηχανολογικού εξοπλισμού έκτασης περίπου 500τμ. Διαθέτει υπόγειες αντλίες σε τρία σημεία, οι οποίες δεν δούλεψαν, καθώς είχε διακοπεί το ηλεκτρικό ρεύμα τρεις ώρες πριν την πλημμύρα. Η ηλεκτρογεννήτρια του μουσείου δεν μπόρεσε να ανταπεξέλθει στη σφοδρότητα του φαινομένου.
Η υπουργός Πολιτισμού και Αθλητισμού -η οποία, την Παρασκευή το πρωί, θα κάνει αυτοψία στο Μουσείο- έδωσε εντολή να αγοραστούν κοντέινερς, ώστε να αδειάσει ο υπόγειος χώρος του Μουσείου, για να μπορέσουν αρχίσουν άμεσα οι εργασίες.
Μετά την αυτοψία της αρμόδιας Εφορείας Αρχαιοτήτων οι ζημιές που προκλήθηκαν, έχουν ως εξής:
α) Ολόκληρος ο χώρος της αποθήκης είναι καλυμμένος με στρώμα λάσπης πάχους περίπου 15εκ.
β) Το σύνολο των κιβωτίων με τα αρχαία αντικείμενα που ήταν τακτοποιημένα στα ειδικά ερμάρια γέμισαν με νερό και λάσπη.
γ) Μεγάλος αριθμός κιβωτίων παρασύρθηκαν από το νερό με αποτέλεσμα να διασκορπιστεί το περιεχόμενό τους σε ολόκληρη την έκταση της αποθήκης.
δ) Ολόκληρη η αποθήκη είναι γεμάτη με έπιπλα, κιβώτια, εργαλεία και μηχανήματα που παρασύρθηκαν από το νερό καθιστώντας δύσκολη και χρονοβόρα την προσέγγιση στο χώρο.
ε) Όλος ο μηχανολογικός εξοπλισμός του μουσείου είναι καλυμμένος με λάσπη και φερτά υλικά. Σημαντικό μέρος του εξοπλισμού ενδέχεται να έχει καταστραφεί ολοσχερώς. Σε κάποια σημεία αποκολλήθηκαν και έσπασαν οι αεραγωγοί του συστήματος κλιματισμού του μουσείου.
στ) Ολόκληρος ο εξοπλισμός και τα μηχανήματα του ανελκυστήρα.
Το μουσείο παραμένει χωρίς ρεύμα. Αυτή τη στιγμή λειτουργεί με γεννήτριες.
Σημειώνεται ότι η Λίνα Μενδώνη, μετά από συνεννόηση με τον υπουργό Δικαιοσύνης Κώστα Τσιάρα, έδωσε εντολή να σταλούν άμεσα από τη Διεύθυνση Συντήρησης εξειδικευμένοι συντηρητές, για να εξετάσουν τις ζημιές που έχουν προκληθεί στα εκθέματα της Δημοτικής Πινακοθήκης.