Η έκδοση John Cooper Works φέρει το νέο λογότυπο JCW, την παραδοσιακή τριχρωμία (κόκκινο, λευκό μαύρο) και την καρό σημαία που δεσπόζει στην οκταγωνική μάσκα. Οι ζάντες αλουμινίου 18ιντσών, 10 ακτίνων, σε δίχρωμη σχεδίαση Lap Spoke και οι εντυπωσιακές, κόκκινες δαγκάνες φρένων JCW αποτελούν στοιχεία της δυναμικής εμφάνισης του MINI Cooper SE JCW. Οι διακοσμητικές ρίγες στο καπό συμβάλλουν στον σπορ χαρακτήρα.
Στον βασικό εξοπλισμό της έκδοσης JCW περιλαμβάνονται εντυπωσιακοί διαχύτες εμπρός και πίσω. Το πλαίσιο της μάσκας και το λογότυπο φέρουν γυαλιστερό μαύρο φινίρισμα. Ιδιαίτερη αίσθηση προκαλεί επίσης το κόκκινο χρώμα αντίθεσης Chilli Red στην οροφή και στα καλύμματα των καθρεπτών. Οι προβολείς MINI LED υιοθετούν ειδικές «φωτεινές υπογραφές». Με επιλεγμένο το γραφικό JCW, τα εμπρός φώτα εμφανίζουν μόνο δύο οριζόντιες λεπτές λωρίδες ως φώτα ημέρας και τονίζουν τη μινιλαμιστική σχεδίαση του νέου MINI Cooper SE. Τα γραφικά των πίσω φωτιστικών σημάτων (matrix) αναδεικνύουν το πλάτος του αυτοκινήτου.
Στην καμπίνα, τα καθίσματα JCW συνδυάζουν συνθετικό δέρμα με κόκκινες ραφές και πολύχρωμο πλεκτό ύφασμα στην περιοχή των ώμων. Η φιλοσοφία μαύρου και κόκκινου συνεχίζεται στην 2d πλεκτή επένδυση στα πάνελ των θυρών και στο ταμπλό. Η πλευρά του συνοδηγού κοσμείται με το ειδικό μοτίβο σε στυλ καρό σημαίας.
Η κεντρική, υψηλής ανάλυσης οθόνη OLED με διάμετρο 24 εκ. ομαδοποιεί δεδομένα του οχήματος και προβάλλει πληροφορίες για λειτουργίες πλοήγησης, πολυμέσων, τηλεφώνου και ρυθμίσεις του συστήματος κλιματισμού. Τα MINI Experience Modes προσφέρουν νέες δυνατότητες εξατομίκευσης. Μεταξύ άλλων, το εμπνευσμένο από την John Cooper Works, GO-KART Mode, χρωματίζουν την οθόνη και τον εσωτερικό φωτισμό σε ανθρακί κόκκινο. Εκτός από τον ειδικό ήχο GO-KART, η βελτιστοποιημένη απόκριση του πεντάλ του γκαζιού επιτείνει τη σπορ οδηγική εμπειρία.
Με ισχύ 160 kW/218 hp και μέγιστη ροπή 330 Nm, το MINI Cooper SE επιταχύνει στα 0-100 χλμ./ώρα σε 6,7 δευτ. Επίσης, η μπαταρία υψηλής τάσης του MINI Cooper SE με ενεργειακή χωρητικότητα 54,2 kWh παρέχει αυτονομία έως 402 χιλιόμετρα.
Ως προς την ασφάλεια, προσφέρεται με νέα συστήματα υποβοήθησης οδηγού. Για παράδειγμα, με 12 αισθητήρες υπερήχων και τέσσερις κάμερες, το Parking Assistant Plus απλουστεύει τη διαδικασία στάθμευσης και εντοπίζει ελεύθερους χώρους στάθμευσης. Η προηγμένη λειτουργία EXPLORE Mode προσφέρει μία μοναδική λύση για τη συγκεκριμένη κατηγορία οχημάτων: συγκεκριμένα, επιτρέπει το παρκάρισμα μέσω smartphone με τον οδηγό εκτός του MINI, η οποία αναβαθμίζει σημαντικά την άνεση όταν ο χώρος στάθμευσης είναι στενός στο πλάι.
Εξάλλου, η ταχεία φόρτιση με συνεχές ρεύμα (DC) είναι εφικτή με έως 95 kW. Αυτό σημαίνει ότι σε έναν σταθμό ταχείας φόρτισης η μπαταρία μπορεί να φορτίζεται από το 10% στο 80% σε λιγότερο από 30 λεπτά. Η μπαταρία υψηλής τάσης φορτίζεται με 11 kW με εναλλασσόμενο ρεύμα (AC). Όταν είναι ενεργοποιημένη η πλοήγηση, η μπαταρία υψηλής τάσης του MINI Cooper SE φτάνει νωρίτερα στην ιδανική θερμοκρασία για αποδοτική φόρτιση, ανάλογα με τις καιρικές συνθήκες. Αυτό μπορεί να μειώσει σημαντικά τον χρόνο φόρτισης, ειδικά σε χαμηλές εξωτερικές θερμοκρασίες.