Την παραίτηση του από τη διεύθυνση του Κέντρου Υποδοχής και Ταυτοποίησης της Μόριας υπέβαλε στην ηγεσία του υπουργείου Προστασίας του Πολίτη, επικαλούμενος προσωπικούς λόγους, ο διοικητής του Γιάννης Μπαλμπακάκης.
Ο κ. Μπαλμπακάκης διοίκησε το ΚΥΤ επί τρία περίπου χρόνια. Στη διάρκεια της θητείας του και παρά την αρνητική κριτική για το ΚΥΤ συνέβαλε στη δημιουργία «ασφαλών ζωνών» για την προστασία των ασυνόδευτων ανήλικων προσφύγων, γυναικών που ταξιδεύουν μόνες και μονογονεϊκών οικογενειών με παιδιά. Συνέβαλε δε και στη σύνδεση της αποχέτευσης του ΚΥΤ με την επεξεργασία λυμάτων του βιολογικού καθαρισμού της Μυτιλήνης. Σημαντική ήταν και η συμβολή του στην αποζημίωση ιδιοκτητών κτημάτων στην ευρύτερη περιοχή του ΚΥΤ τα οποία είχαν καταληφθεί από αιτούντες άσυλο.
«Φεύγω με ψηλά το κεφάλι για το ότι έκανα αυτό που έπρεπε σε δύσκολες καταστάσεις. Δεν φεύγω ούτε σαν κλέφτης ούτε αποχωρώ ως διαμαρτυρόμενος πολιτικός. Φεύγω επειδή πρέπει να φύγω. Κουράστηκα...», δήλωσε στο ΑΠΕ-ΜΠΕ ο κ. Μπαλμπακάκης.